前庭大腺囊肿多是由于前庭大腺管阻塞、分泌物积聚而无法排出逐渐形成的。急性期的前庭大腺脓肿，炎症逐渐消退后腺管堵塞或者前庭大腺受到损伤，如常见的会阴和阴道裂伤后形成的瘢痕阻塞腺管，或者在分娩时会阴侧切损伤了腺管，都可以导致前庭大腺囊肿的发生。