会破坏正常菌群，抗生素药物杀灭病菌的时候也会杀灭非致病菌，尤其是肠道益生菌，所以会出现肠道菌群紊乱，甚至长期腹泻或者是便秘。也会导致病菌产生耐药性，使用抗生素药物就会没有效果，还会伴随毒性反应，损害肝脏功能。一部分患者会出现过敏反应，任何药物都应该避免长时间服用。