怀孕40天的时候是不能同房的，当然也就不能将精液射在女性的阴道里面。对于怀孕的女性来说，精液射在女性的阴道里面本身并没有影响，但是在怀孕40天的时候同房容易因为性生活刺激诱发子宫收缩而引起流产的表现。对于怀孕前三个月的女性来说，都应当禁止同房。但是，如果发生了同房的行为，是可以将精液射入阴道里面的。