HPV31阳性可以选择使用干扰素胶囊来进行治疗，也可以选择保护康栓来提高自身的免疫力。具体需要用什么药，可以根据病人自身的身体情况和病情的严重程度来判断，到正规的医院做一个详细的检查自身情况来选择合适的方案，可以达到好的治疗效果，患者平时要注意多休息。