最适合做药物流产的时间是在怀孕35天到49天之间。需要先通过超声检查确定妊娠囊位于子宫腔内，怀孕的时间没有超过49天、也不少于35天，才可以服用流产的药物终止妊娠。如果多次进行过人工流产手术或者是子宫内膜炎比较严重，就不适合做药物流产，否则容易出现流产不全，流产失败的现象。