女性衣原体阳性是比较严重的，在非淋菌性尿道炎中有一半以上是由于衣原体感染而导致的。女性感染了沙眼衣原体后容易导致尿道综合症，女性不孕症，盆腔炎或者子宫颈炎症等。如果是孕妇感染还可能会导致流产，宫外孕，死胎或者早产等。建议在确诊病情后需要有针对性的安排治疗，提高身体的免疫力。