体检的时候能否检查出来有过性行为，关键看做的是哪一方面的体检内容。如果只是进行普通的常规体格检查，当然是检查不出来是否有过性行为的。如果是因为阴道里面有瘙痒、疼痛、肿胀的症状而进行体检，这种情况就需要对外阴和阴道进行常规妇科检查，可以检查出来近期发生过性行为。