如果是治疗霉菌性阴道炎，在月经期间也是可以应用药物来进行治疗的，这个时候可以选择一些口服的抗真菌药物治疗。如果要采取阴道内用药治疗霉菌性阴道炎，可以在月经干净以后三天再阴道内用药。如果是有霉菌性的阴道炎，可以先用一些碱性的溶液冲洗阴道，然后再应用抗真菌药物，这样效果相对比较好。