吃小金丸有可能会影响月经。因为小金丸具有活血以及化瘀，并且还有止痛以及消炎等作用，所以在女性月经期间，如果吃小金丸的情况下，有可能会使月经增多甚至是月经周期延长的现象，一般情况下吃小金丸要在月经干净后，禁止在月经期间服用。而且在服药期间一定要到医院进行复查，因为有极少部分患者会出现不良反应。