附件巧克力囊肿可能是由经血滞留、子宫内膜异位或妇科炎症导致的。患者可能会有月经失调和痛经的现象，严重者会导致不孕不育，可以口服雌激素或孕激素进行治疗，坚持一段时间后看囊肿是否能减小或消失。如果没有减小反而进一步增大时，这时候应考虑进行手术，大部分患者都可治愈。