怀孕后5周是可以做药物流产的，但是在用药之前需要先到医院做彩超检查，主要是看一下孕囊的大小，如果宫腔内有正常的孕囊，才可以遵医嘱安排用药，否则过早的用药可能会导致流产失败，或者会增加宫外孕的几率。药物流产成功的几率是比较大的，但是在流产之后需要尽快的复查，预防感染。