怀孕41天做b超不一定能看出孕囊。这个主要跟女性的月经周期有关，如果月经周期比较短，通常是在28天左右，或者月经推前，那么怀孕41天做b超是可以明显的看到孕囊的，有的还能看到胎心。如果月经周期比较长，通常是超过30天或者月经经常推后，怀孕41天，做b超是不容易看到孕囊的。