阴超对孕囊是有危害的。这时候在女性怀孕后如果想继续妊娠，最好不要做阴道超声检查，可以去做腹部的憋尿B超进行检查，对孕囊的发育就不会造成不利的影响。而用阴道超声检查有可能会导致由孕囊下移而引起先兆流产的几率增高，因此这时候如果是不想继续妊娠，可以用阴道超声进行检查。