月经干净后两天做乳腺彩超通常来说是没有影响的，在月经结束以后，乳房一般不会出现胀痛的情况，可以进行相应的治疗和检查，如果出现了慢性炎症，一定要及时进行消炎治疗，密切的观察自己的身体变化，及时跟医生进行沟通，最好穿一些纯棉宽松式的胸罩。