黄体萎缩不全是会影响怀孕的。因为孕妇黄体功能不全的情况是比较容易发生习惯性流产的，如果真的想要小孩，建议还是到正规的医院去做进一步检查，配合医生的治疗，现在医学水平治愈是没有问题的。治疗期间请避免吃一些生冷、辛辣和刺激性比较大的食物，饮食主要以高蛋白，高维生素为主，保持心情愉悦。