怀孕三个月腰痛的厉害，它的发病原因：1、由于怀孕以后腰部的肌肉有可能会充血水肿，怀孕后身体负重增加，就会导致腰部疼痛的症状。这种情况适当地多休息就能够减轻症状。2、流产前兆，去医院做彩超检查，必要的话需要住院保胎治疗。3、本身有腰间盘突出症，由于怀孕以后子宫增大，导致腰部负重增加，这样就会引起腰痛的严重现象。