怀孕43天的时候可以做药物流产。做药物流产之前首先需要做超声检查，观察妊娠囊所在的具体部位，测量妊娠囊的各个径线。只要确诊是宫腔内妊娠，而且怀孕的天数没有超过49天就可以做药物流产。做药物流产的时候，大部分都能够一次性流干净，但是也有部分会存在流产失败或流产不全而需要清宫的现象。