怀孕50天是不可以做药物流产的。药物流产一般怀孕时间控制在49天以内，而且在实施药物流产前，需要去医院做相关检查，比如彩超、血常规、尿常规、出凝血时间，心电图等。只有各项指标符合药物流产的指征，才可以服用药物进行流产。怀孕50天以上，建议最好根据具体情况实施无痛人工流产手术终止妊娠。