是否会影响怀孕应该根据囊肿的大小来进行判断，如果囊肿体积比较小，不会影响受精卵着床，当卵巢囊肿体积比较大的时候，可能会对女性的输卵管产生影响，甚至还会引起输卵管出现堵塞，导致女性出现不孕不育，是需要及时到医院通过手术切除来进行治疗，手术以后也要进行病理分析。