怀孕40天，孕囊是有可能自己掉下来的。怀孕40天的时候，如果孕囊自己掉下来，就是发生了自然流产。在怀孕的5~8周内，是自然流产发生率最高的时间。这个时间段内，如果受到理化因素的损伤或者病毒感染影响，或者胚胎本身发育异常，都有可能出现自然流产的现象。