怀孕39天，一般是可以做人流手术的，但还需要看具体情况。原则上来讲，能否做流产，主要是看孕囊大小，单纯看怀孕天数不一定可靠。因为平时所说的“怀孕天数”是根据末次月经第一天开始计算的，这只是理论上的怀孕天数，并不代表就是实际怀孕天数，因为排卵期是不一定的。所以说，做流产之前，一般需要做B超检查，若是孕囊大小在2.0cm以上，就可以做流产的。