孕妇使用红霉素眼膏不会致畸的，不要担心，红霉素在妊娠期使用药的分级中属于B级，B级属于对胎儿没有不良影响的一类，孕期可以使用的，而且红霉素眼膏是外用更不会影响的，怀孕期间脸上长疙瘩，有可能是体内激素水平高引起的，建议最好去医院皮肤科看一下排除其他皮肤病。