怀孕三个月的时候甲状腺偏低会对胎儿有影响的。有可能会导致流产、早产或者胎儿出生后体重偏低、智力下降。但是在怀孕早期的时候有可能促甲状腺素含量有偏低的现象，一般进入孕中晚期的时候就会恢复正常。需要在医生的诊断下。如果已经确诊是甲状腺功能亢进，必须要在医生的指导下服用药物控制治疗。避免影响胎儿的健康发育。