怀孕41天看不到孕囊，有可能是正常现象，但也有可能是宫外孕等。如果平时月经周期比较长的女性，比如40天左右来一次月经，怀孕41天做B超检查，当然看不到孕囊，因为实际怀孕时间才一个月左右。如果平时月经比较规律，需要抽血检查一下hcg。如果hcg在2000以上，这时要警惕是不是宫外孕。