孕囊变形一般是由于孕早期体内的孕酮水平不足或者胚胎的质量有问题引起。如果胚胎发育不良可能会导致孕囊萎缩变形。可以联合抽血检查，判断血hcg和孕酮的水平是否有问题。一旦确诊胚胎发育不良后，可以到正规的医院做流产手术，否则对身体的影响比较大，可能会引起阴道不规律出血的现象。