有影响，在做无痛肠镜的时候，一般需要使用麻醉药物，可能会对胎儿的生长和发育产生不利影响，如果能够延缓，尽量要在怀孕三个月后到正规医院进行无痛肠镜检查。孕早期要多吃叶酸含量高的食物，可以避免胎儿发生神经管畸形。而且怀孕早期胚胎发育是不稳定的，很容易受到药物或者是其他因素的影响。