在怀孕晚期检查链球菌阳性，主要的原因是在怀孕期间，可能抵抗力是比较差，会导致链球菌的感染，而引起的阳性结果。出现这样的结果也不要大意的，因为感染链球菌可能会引起早产，甚至胎膜早破等一些不良情况，所以需要按照医生的建议，根据孕妇的具体情况，及时采取相对应的治疗措施。