男性在医院做支原体取样时并不会有剧烈的疼痛感，只不过会有轻微的不适感，一般都是能够忍受的。需要注意的就是在支原体取样后，建议男性要适当地多喝一些水，促进排尿的同时还能够对尿道进行一定的冲洗，这对于预防尿路感染会有非常大的帮助。检查结果出来后如果的确存在某种问题，则需要在医生的帮助下积极进行治疗。