男生生殖器官上长了一个黑痣的原因，可能是由于出现了皮肤病变的原因导致的，是由于黑色素的堆积形成的。如果突然出现了一个黑痣，最好是要及时的到医院去做一个检查，避免是由于黑色素肿瘤的原因导致的，否则是会有生命的危险的。