自慰后小肚子疼很有可能是因为患者在自慰的过程中对于体内的一些器官造成了一定的损伤，也很有可能是因为患者的月经期要到了。如果患者的月经期要到了，就会出现有强烈的激素分泌行为时肚子疼痛的情况，患者最好是及时的到当地正规的医院去进行一个详细的检查，根据医生的指导来进行治疗。