导致生殖器上面有水泡的原因有很多中，例如生殖器疱疹，尖锐湿疣，尿道炎，还有其他的性病等，最好去正规的三甲医院进行检查，找出具体的病因，在医生的帮助下进行治疗。患者平时的时候一定要注意下体的清洁与卫生，勤换内衣裤，毛巾等物品定期的进行消毒，治疗期间不要进行性生活。