霉菌性尿道炎的患者，可以口服抗真菌的药物治疗。在口服抗真菌药物的同时，可以服用碳酸氢钠片，帮助碱化尿液，可以提高治疗效果。抗真菌的药物种类比较多，具体的药物必须遵照医嘱选择。霉菌性尿道炎的患者，可能会通过性生活的途径在性伴侣之间交叉感染，需要注意暂时禁止性生活。