由于精囊炎往往继发于前列腺炎，随遇细菌性感染，所以治疗上还是以抗生素抗感染治疗为主。可以使用头孢类以及喹诺酮类抗生素（过敏者禁用)，抗生素使用需要症状小时后再使用2周，以免迁延不愈，变成慢性。还可以使用黄连素灌肠治疗。对于一直有血精者，可以服用乙底酚、强的松等药物。