小男孩蛋蛋疼可能是因为细菌感染导致的或者是睾丸疾病引起的，可以在医生的指导下使用一些甲硝唑的药物进行治疗的，在治疗的这段时间一定要多观察宝宝的情况，一般都会出现生殖器的疼痛或者是出现生殖器的红肿。若是其他睾丸疾病，应完善检查，明确病因后继续治疗。