三个月宝宝口水疹，可以在局部涂抹消炎杀菌类的药膏进行治疗，必要时也可以口服抗病毒类的药物进行治疗。在治疗期间应注意局部的卫生和干燥，要及时的对患部进行清洗，避免用手抓挠，以免出现细菌感染。如果患儿是吃母乳，宝妈在饮食上也要避免辛辣或生冷等刺激性的食物。