三个月的小宝宝拉水便考虑是因为宝宝的肠道菌群没有发育完全，胃肠功能不健全，以及消化功能不健全而引起的。宝宝出现这种情况，可能是因为生理性的腹泻主要常见于母乳喂养，随着月份的增长，这种情况就会慢慢好转。如果是喂养不当，宝宝吃的过多或者着凉，可能也会引起拉水样便。