胚胎停止发育的病因，包括胚胎因素、母亲因素、父亲因素和环境因素，胚胎因素是胚胎或者胎儿的染色体异常所致。母亲的因素包括孕妇患全身性疾病，比如严重的感染，高热，或者生殖器官发育异常，比如子宫畸形，内分泌异常。父亲的因素主要是精子的染色体异常，包括环境因素，以及要避免接触放射性线的接触和重金属因素等。