怀孕早期可以做亲子鉴定，但是效果不是很好，可以在怀孕四个月之后去做亲子鉴定，因为妊娠16周的时候，胎儿的发育已经基本上稳定了，这个时候从母体提出少量的羊水不会影响到胎儿的正常生长发育，对孕妇和胎儿的伤害都是比较小的，孕妇要注意在怀孕期间做亲子鉴定，可能会在羊水穿刺之后发生感染的现象。