孕囊不规则的原因有很多，主要包括月经不规律，精液质量差，遗传因素，孕妇怀孕期间精神过度紧张，接触过不良物质等。孕囊不规则，需要再检查一下血hcg值和孕酮的数值是否正常，如果血中hcg值和孕酮数值都正常，那主要考虑与平时月经不规律，怀孕天数短有关，建议两周后再做一次复查。