男性查染色体什么时候去都可以，一般是通过出外周血进行检查比较好的，有利于检查男性的染色体是否正常，有无移位，三体，缺失等的情况发生。导致女性不孕的因素不光是与男性因素有关，也与女性因素有关，因此男女双方都要做个全面的查体，有利于明确原因对症治疗。