一般不会出现疼痛，子宫内膜异位症一般会在月经期间出现肚子疼痛，这是一种剧烈性疼痛，如果在平时的时候也出现疼痛，一般是盆腔炎症所诱发。对于患者存在卵巢巧克力囊肿比较严重时，也会对神经造成压迫，从而会引起下腹部疼痛。引起下腹部疼痛的原因有多种，需要找到原发病因之后对症治疗。