孕酮低的原因有：一：多是由于黄体功能不全，卵巢黄体发育不全时，孕酮含量相应降低。二：肾上腺、甲状腺功能严重失调也可影响卵巢功能，使排卵发生障碍，孕酮含量也会相应降低。三：身体出现胰岛素抵抗。孕酮低对女性来说，怀孕前会导致不孕不育，怀孕后会增加流产的风险。