精子畸形率96%是不能够正常怀孕的，很容易会导致发生胚胎停育，自然流产的几率增高。因此正常情况下精子的畸形率一般最好是控制在20~30%左右是比较合理的。若是精子畸形率高的情况，最好是采用人工授精，在体外选择高质量的精子进行与卵子结合，才能够提高女性怀孕正常怀孕的几率。