发生胚胎停育跟孕酮低是有一定的关系的，如果是孕酮低就会抑制胚胎的着床发育，导致出现有胚胎停育，先兆流产几率增高。但是导致胚胎停育不光与孕酮低有关，另外也与受精卵的质量差，子宫内膜营养不充足，易栓症，免疫方面因素，吸烟喝酒，细菌，药物等多方面的原因有关。