主要区别是检查方式不一样，肠道造影是通过硫酸钠和泛影葡胺等造影剂进行观察，然后再放热下观察肠道蠕动和肠道生态，从而判断是否有结肠病变。而肠镜是通过光导纤维的镜头进入肠腔内，在肠腔内进行观察，并且还可以把图像放大，然后进行电子染色，可以直接取病理活检，更准确的诊断肠道疾病。