检查性激素六项一般是在月经第二天。但是，这个说法并不完全科学，体内性激素水平是随着月经周期变化而呈周期性变化的，换句话说，在不同的月经周期，激素水平是不一样的，化验性激素六项最好是在月经、早、中晚期分别化验，也就是在卵泡期、排卵期、黄体期分别做化验，单纯的一次化验是不能完全说明问题的。