沙眼衣原体和衣原体的区别是衣原体，包括沙眼衣原体，都是一种原核微生物，主要寄生在人体细胞内。而沙眼衣原体如果人体感染后，容易造成眼部疾病，比如眼睑内有红色的小丘疹，引起眼部摩擦疼痛，严重时会导致结膜炎症。可以在医生的指导下使用治疗沙眼衣原体的眼药水进行改善，通常能起到比较好的效果。