眼睛不舒服，去医院应该挂眼科。眼睛如果再出现不舒服的时候，有可能就是过度疲劳或者是眼角膜炎所导致的，但是也有可能是其他疾病，在平时里出现眼睛不舒服的时候，是不可以用手去揉搓的，因为用手揉搓的话，就有可能会出现细菌感染，可以用一些滴眼液来缓解症状。