老是在凌晨二到三点的时候心口疼，一般都与十二指肠溃疡有关。十二指肠溃疡是消化系统的一种常见疾病，可能与饮食因素或者是微生物感染有关。一般都表现为在半夜里面，肚子饥饿的状态下出现疼痛感。可以到医院去做胃镜检查，进一步明确病情。确诊后，遵医嘱进行适当的药物治疗和饮食调理。