临床上通常不建议采用碘甘油来治疗口腔溃疡。碘甘油虽然能够具有消炎止疼的作用，但是它对粘膜的刺激性还是比较大的，如果直接涂抹在溃疡创面上，会对口腔溃疡面造成一定的刺激，不利于口腔溃疡的愈合。可以采用含碘的其他的含漱液来治疗口腔溃疡。比如目前临床常用的聚维酮碘含漱液能够促进口腔溃疡愈合。